索尼克渐渐适应了地球的生活,它融入了新的家庭,并且得到了人类的信任。不过好景不长,蛋头博士依旧准备前来搞破坏,这一次他将和纳克鲁斯一起,夺取整个人类的财富,并摧毁整个文明系统。在不得已之下,索尼克只好重新回到战场,与恶人展开战斗。